L'Agence Foncière Rurale (AFOR) est dirigée par un Directeur Général nommé par décret, sur proposition du Ministre chargé de l'Agriculture et du Ministre chargé du Portefeuille de l'Etat. L'actuel Directeur Général de l'AFOR est le Ministre BAMBAa Cheick Daniel, Préfet Hors-grade et ancien Ministre de l'Intérieur de la Côte d'Ivoire. Le Directeur Général est investi du pouvoir de décision nécessaire à la bonne marche de l'AFOR.
Le Directeur Général Adjoint est également nommé par décret, sur proposition du Ministre chargé de l'Agriculture et du Ministre chargé du Portefeuille de l'Etat. L'actuel Directeur Général Adjoint de l'agence Foncière Rurale (AFOR) est M David Loué, Ingénieur Agronome.